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Enregistrement W2323809226 · doi:10.1139/cjm-2013-0133

Acidic amino acids increase fusion activity in the specific fusion domain of Newcastle disease virus fusion protein

2013· article· en· W2323809226 sur OpenAlexvenueno aff
Guijie Ren, Yunlong Zhuang, Keli Tian, Huiyu Li, Xueqin Diao, Miaomiao Wang, Nan Zhou, Zhiyu Wang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVirology and Viral Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusion proteinCell fusionBiologyMutantMolecular biologyLipid bilayer fusionHeterologousVirusHemagglutinin (influenza)VirologyCellGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To explore the effects of amino acids Gln and Asn within the specific fusion domain of fusion (F) protein on the specific membrane fusion in Newcastle disease virus (NDV), the mutants Q204E-Q205E and N245D were constructed in the specific fusion domain of F protein. The mutant genes were co-expressed with homologous or heterologous hemagglutinin-neuraminidase (HN) in BHK21 cells. Cell fusion functions of mutants were analyzed with Giemsa staining and reporter gene methods. Cell surface expression efficiency was analyzed with immunofluorescence assay and fluorescence-activated cell sorter analysis. Co-immunoprecipitation was performed to analyze the interaction of mutant F proteins with the homotypic HN protein. Both Q204E-Q205E and N245D mutations caused increased cell-cell fusion activity when they were co-expressed with homotypic HN protein. The mutant F proteins had slight changes in cell surface expression compared with that of wild-type F protein. The interactions of Q204E-Q205E or N245D with their homotypic HN increased significantly (P < 0.01) compared with the wild-type F protein. Neither Q204-Q205E nor N245D caused cell fusion in the presence of heterologous HN protein. Our data suggested that the residues Q204, Q205, and N245 play a critical role in the regulation of cell fusion. They may decrease the interaction of wild-type NDV F and NDV HN to suppress the fusion activity for survival of the infected host, which may enable a persistent virus infection and long-term virus reproduction and spread.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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