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Enregistrement W2324472998

GLUCAN SYNTHASE-LIKE 8: A Key Player in Early Seedling Development in Arabidopsis

2016· article· en· W2324472998 sur OpenAlexfundno aff
Behnaz Saatian

Notice bibliographique

RevueScholarship@Western (Western University) · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Physiology and Cultivation Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésSeedlingArabidopsisKey (lock)BiologyBotanyChemistryBiochemistryEcologyGeneMutant
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants’ cell walls have unique chemical composition and features which enable them to play essential roles during plant development as shaping the cells and providing intercellular communication between adjacent cells. Polysaccharides, including callose, and glycoproteins are known as the main constituents of the cell wall. Callose, a linear β-1,3-glucan polymer, is accumulated at the cell plate during cytokinesis, in plasmodesmata, where it regulates cell-to-cell communication, in dormant phloem, where it seals sieve plates after mechanical injury and pathogen attack, and in male and female gametophytes. GLUCAN SYNTHASE-LIKE (GSL) genes in Arabidopsis comprise a family of 12 members. A new allele of GSL8, essp8, was identified as having seedling-lethal phenotype through a genetic screen for Arabidopsis mutants showing ectopic expression of seed storage proteins (essp). The gene responsible for the observed mutant phenotype was detected using a combination of bulked-segregant analysis, rough-mapping, and next-generation mapping. An EMS-induced point mutation was identified at an intron splice site of GSL8, predicted to introduce a premature STOP-codon. essp8 seedlings exhibit pleiotropic phenotypic defects, including disruption of root tissue patterning, dwarfism and seedling lethality. Histochemical detection of callose and cell-to-cell diffusion assays showed reduction of callose deposition at the cell plates and plasmodesmata, cytokinesis defects and significant increase in size exclusion limit of plasmodesmata in essp8 seedlings. Further investigation showed that the increase in size exclusion limit leads to an alteration in symplastic trafficking in primary roots of essp8 seedlings. Plasmodesmata defects in essp8 induce ectopic movement of two non-cell-autonomous factors, SHORT ROOT and microRNA165/6, both required for root radial patterning during embryonic root development. Attempts to identify the components of a hypothetical callose synthase complex revealed the interaction of GSL8 with two plasmodesmata-associated proteins, PLASMODESMATA-LOCALIZED PROTEIN 5 and β-1,3-GLUCANASE, as well as SUCROSE SYNTHASE 1, suggesting that they all might be parts of a single complex. The proposed putative complex might regulate callose deposition at the plasmodesmata and thereby determines the size exclusion limit. In summary, my findings suggest that GSL8 is required for cell wall integrity, maintaining the basic ploidy level and regulation of symplastic movement during early seedling development in Arabidopsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
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