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Enregistrement W2324475251 · doi:10.1038/ismej.2008.18

Viruses in granitic groundwater from 69 to 450 m depth of the Äspö hard rock laboratory, Sweden

2008· article· en· W2324475251 sur OpenAlexaff
Jennifer Kyle, Hallgerd S C Eydal, F. G. Ferris, Karsten Pedersen

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesSwedish Foundation for International Cooperation in Research and Higher Education
Mots-clésLytic cycleBiologyGroundwaterBacteriophageVirusGeomicrobiologyAbundance (ecology)MicroorganismBK virusMicrobiologyVirologyEcologyBacteriaGeologyPaleontologyGeneEscherichia coliKidney

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objectives of this study were to determine if viruses exist in deep granitic groundwater and to analyse their abundance and morphological diversity. Fluorescent microscopy counts on 10 groundwater samples ranging from 69 to 450 m depth were in the range of 10(4)-10(6) TNC ml(-1) (TNC, total number of prokaryotic cells) and 10(5)-10(7) VLP ml(-1) (VLP, virus-like particles). A good positive correlation of VLP with TNC (r=0.91, P=0.0003) was found with an average VLP/TNC ratio of 12. Transmission electron microscopy revealed four distinct bacteriophage groups (polyhedral, tailed, filamentous and pleomorphic) with at least seven phage families of which some are known to be lytic. Our results suggest the presence of viruses in deep granitic groundwater up to 450 m depth. If they are active and lytic, they will constitute an important group of predators that might control the numbers of microorganisms in the analysed groundwater.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,924
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations116
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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