LRRK2 is not a Significant Cause of Parkinson's Disease in French-Canadians
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: An old founder mutation (G2019S) was found with high frequency in the North African Arabs (30%) and Ashkenazi Jews (18% ). OBJECTIVE: Demonstrate if mutations in the LRRK2 gene are a significant cause of Parkinson's disease (PD) in the French-Canadian founder population. METHODS: Cases were recruited through a designated movement disorder clinic in Quebec City. Every index case had to meet the Ward and Gibb criteria for PD. Controls consisted of a non-disease group of similar age and ethnicity as the cases. Exons 31 and 41 of LRRK2 were amplified by PCR with intronic primers in all 125 PD cases and directly sequenced on an ABI 3700 sequencer. Six single nucleotide polymorphism were typed in 125 PD cases and 95 normal controls. Associations between unrelated cases and matched controls were analyzed. Single marker analysis and haplotype association tests were performed. RESULTS: Sequencing analysis did not reveal any reported or novel mutations in exons 31 and 41 of LRRK2. The G2019S mutation as well as mutations affecting amino acid 1441 were absent in the 125 patients. The case-control association study performed to detect the presence of a common variant in LRRK2 did not provide any positive signal. Single-marker and haplotype analyses systematically gave non-significant P values. CONCLUSIONS: We performed a case-control association study in 125 French-Canadian (FC) patients with PD and 95 FC controls and found that common variants in LRRK2 are unlikely to be a significant cause of late-onset PD in this founder population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».