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Enregistrement W2325217990 · doi:10.1139/bcb-2012-0080

Mechanism of cardiomyocyte PGC-1α gene regulation by ERRα

2012· article· en· W2325217990 sur OpenAlexafffundvenue
Angela Ramjiawan, Rushita A. Bagchi, Laura Albak, Michael P. Czubryt

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCoactivatorChromatin immunoprecipitationGene knockdownBiologyNuclear receptorRegulation of gene expressionCell biologyGene expressionMitochondrial biogenesisHistone deacetylasePeroxisome proliferator-activated receptorTranscription factorHistoneGeneMitochondrionPromoterBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) γ coactivator 1α (PGC-1α) regulates critical genes involved in cardiac mitochondrial biogenesis and fatty acid oxidation, and its loss is associated with impaired metabolism and various cardiac pathologies. Estrogen-related receptor α (ERRα) targets many of the same genes as PGC-1α, and extensive cross talk exists between these 2 regulators. Here we report the identification of an evolutionarily conserved ERRα binding site within the PGC-1α promoter. Using luciferase reporter assays and overexpression, inhibition, or knockdown of ERRα, we show that PGC-1α expression is critically dependent upon ERRα in primary cardiomyocytes. We demonstrate that short-term hypoxia results in reduced ERRα mRNA expression, which precedes a similar loss of PGC-1α mRNA. However, chromatin immunoprecipitation reveals that despite a key role for ERRα in regulating PGC-1α in normoxic cardiomyocytes, ERRα loss is not responsible for PGC-1α loss in hypoxia. Histone deacetylase 5 (HDAC5) has previously been demonstrated to strongly inhibit expression of PGC-1α, and we show that overexpression of ERRα is sufficient to overcome this repressive effect. Our data elucidates the mechanism by which ERRα regulates cardiac PGC-1α gene expression, and suggests that ERRα may provide a means to normalize PGC-1α expression that could be useful in the development of strategies aimed at improving cardiac metabolism in disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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