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Enregistrement W2325233772 · doi:10.1021/bi101316y

Multiple, Distributed Interactions of μ-Conotoxin PIIIA Associated with Broad Targeting among Voltage-Gated Sodium Channels

2010· article· en· W2325233772 sur OpenAlexfundno aff
Jeffrey R. McArthur, Vitaly Ostroumov, Ahmed Al-Sabi, D. McMaster, Robert J. French

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSodium channelChemistryToxinBiophysicsArginineBiochemistryStereochemistrySodiumAmino acidBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The first μ-conotoxin studied, μCTX GIIIA, preferentially blocked voltage-gated skeletal muscle sodium channels, Na(v)1.4, while μCTX PIIIA was the first to show significant blocking action against neuronal voltage-gated sodium channels. PIIIA shares >60% sequence identity with the well-studied GIIIA, and both toxins preferentially block the skeletal muscle sodium channel isoform. Two important features of blocking by wild-type GIIIA are the toxin's high binding affinity and the completeness of block of a single channel by a bound toxin molecule. With GIIIA, neutral replacement of the critical residue, Arg-13, allows a residual single-channel current (~30% of the unblocked, unitary amplitude) when the mutant toxin is bound to the channel and reduces the binding affinity of the toxin for Na(v)1.4 (~100-fold) [Becker, S., et al. (1992) Biochemistry 31, 8229-8238]. The homologous residue in PIIIA, Arg-14, is also essential for completeness of block but less important in the toxin's binding affinity (~55% residual current and ~11-fold decrease in affinity when substituted with alanine or glutamine). The weakened dominance of this key arginine in PIIIA is also seen in the fact that there is not just one (R13 in GIIIA) but three basic residues (R12, R14, and K17) for which individual neutral replacement enables a substantial residual current through the bound channel. We suggest that, despite a high degree of sequence conservation between GIIIA and PIIIA, the weaker dependence of PIIIA's action on its key arginine and the presence of a nonconserved histidine near the C-terminus may contribute to the greater promiscuity of its interactions with different sodium channel isoforms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,806

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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