Single Nucleotide Polymorphism of Wx Gene Associated with Amylose Content in Barley Germplasm
Notice bibliographique
Résumé
Objective Waxy gene (Wx in short) is a key gene responsible for the barley amylose synthesis.The objective of the present study was to detect single nucleotide polymorphisms (SNP) of Wx and determine the relationship between SNP and amylose content of seed in barley.Method After PCR amplification and gene clone,30 Chinese normal and waxy barley cultivars,which had high,medium and low amylose content respectively,were sequenced and polymorphism was analyzed for waxy gene with 2 Canadian waxy barley as controls.Result By polymorphism identification of waxy gene nucleotide sequences for the 32 barley cultivars,169 polymorphism sites were identified,which included 143 SNP and 26 InDel with frequencies of 1/310 and 1/196,respectively.It was found that the introns 1,3,5,8,exons 2,5 and 5'-UTR,3'-UTR were the rich nucleotide variation regions.Exon 2 and intron 1 suffered stronger selection pressure.Four haplotypes were identified from 32 plant materials.Among them,haplotype 1 included all low amylose content accessions.Conclusion The results of research showed that there is a clear correlation between SNPs in waxy gene and amylose content in barley.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».