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Enregistrement W2325689136 · doi:10.1136/sextrans-2011-050109.140

O4-S1.02 Molecular cloning and expression of hydrogenosomal malate dehydrogenase of<i>Trichomonas vaginalis</i>

2011· article· en· W2325689136 sur OpenAlexaff
Shahed Ardalan, C Lee, Gary Garber

Notice bibliographique

RevueSexually Transmitted Infections · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMalate dehydrogenaseMolecular biologyTrichomonas vaginalisRecombinant DNABiologyRestriction enzymeMolecular cloningGeneBiochemistryPeptide sequenceEnzymeMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Trichomoniasis, a sexually transmitted disease caused byTrichomonas vaginalis, is associated with adverse pregnancy outcomes, and increased risk of HIV acquisition. Malate dehydrogenase (MDH), which catalyses the interconversion of malate to oxaloacetate, has a pivotal role in the survival and pathogenicity of this amitochondrial protozoan. The objective of this study was to clone and express Malate dehydrogenase gene ofT vaginalis, and analyse the biological function of this hydrogenosomal enzyme. Methods The MDH gene from a clinical isolate ofT vaginaliswas amplified by PCR, and cloned into pET101/D-TOPO vector with a C-terminal 6XHis tag. Positive clones were screened and identified by restriction endonuclease digestion and sequence analysis. The plasmid pET101/D-MDH was then transformed into E.coli BL21(DE3) to express after IPTG induction. The expression product further analysed by sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and Western blotting. The recombinant protein was purified with Ni-NTA agarose under native conditions. Western blot, using antibody raised against whole cellT vanginalis, was performed to determine the immunogenicity of purified recombinant protein. Results The recombinant plasmid pET101/D-MDH was constructed successfully. High homology (98%) of nucleotide sequence was revealed between the cloned MDH and the corresponding gene. The recombinant protein showed a high expression level when induced with 1 mM IPTG at 37° C for 4 h. SDS-PAGE analysis showed that the recombinant MDH protein with the correct molecular weight (about 60 kDa) was expressed in E.coli BL21 (DE3). Western blotting revealed that the purified recombinant protein was specifically recognised by sera from mice infected with whole cellT vaginalis. Conclusions A prokaryotic expression system ofT vaginalisMalate dehydrogenase gene has been established successfully. The immunogenicity of the recombinant protein has been tested. The present study shows that the recombinant MDH is specific and suitable for use as an antigen for detecting anti-Trichomonas vaginalisIgG antibodies. Our work has established a good foundation for future studies onT vaginalisvaccine construction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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