Identification of ISSR Markers for Studying the Biodiversity of Bulgarian Representatives of Genus<i>Orobanche</i>Subsection<i>Minores</i>
Notice bibliographique
Résumé
The family Orobanchaceae consists of parasitic species. One group of taxonomically problematic species is subsection Minores (Beck) Teryokhin genus Orobanche. The species in this subsection (except O. crenata) have been often assigned to aggregate O. minor because of their great morphological similarity. The aim of this study was to find useful molecular makers for characterization of the biodiversity of subsection Minores, Orobanche in Bulgaria and their phylogenetic relationships.Six species of subsection Minores were examined: O. minor Sm.; O. amethystea Thuill.; O. esulae Pančić var. bulgarica T. Georgiev, O. pubescens d'Urv. O. loricata Rchb. and O. crenata Forssk. Genomic DNA was isolated from flowering stems and used as a template for ISSR PCR performed with ten different ISSR primers. The ISSR products were separated on agarose gel and visualized by UV-light. The molecular masses of the polymorphic bands were determined and used to fill Boolean matrices that were subjected to cluster analysis. The suitability of each primer for distinguishing each of the studied species was discussed. The resulting cladogram, based on the average Euclidean distances, displayed grouping by species and by geographic populations. This study confirmed that the assignment of the small-flowered species to agg. O. minor has only practical value and is not genetically justified. The study confirmed the independent taxonomic status of the Balkan endemic species O. esulae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».