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Enregistrement W2326249266 · doi:10.1097/pas.0000000000000648

Expression of OCT4 and SALL4 in Diffuse Large B-cell Lymphoma

2016· article· en· W2326249266 sur OpenAlexaff
Andrew S. Williams, Allam Shawwa, Jennifer Merrimen, Kelly Dakin Haché

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGerminal centerDiffuse large B-cell lymphomaBiologyLymphomaGerm cellPathologyCD5Cancer researchGerm cell tumorsB cellImmunologyMedicineGeneticsGeneAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OCT4 and SALL4 are transcription factors within a complex network that functions to maintain pluripotency in primitive stem cells and germ cells. Nuclear expression of OCT4 is widely cited as sensitive and specific for primary and metastatic germ cell tumors and is commonly used in the diagnosis of central nervous system (CNS) germinomas. Studies have failed to systematically examine the expression of OCT4 or SALL4 in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), although this entity enters the morphologic differential diagnosis of some germ cell tumors. A retrospective review was conducted on 145 consecutive cases of DLBCL and testicular lymphoma to evaluate the prevalence of OCT4 and SALL4 expression. Nuclear OCT4 expression was present in 2/11 (18%) testicular DLBCLs and 6/134 (4.5%) nontesticular DLBCLs. Most OCT4 cases demonstrated moderate to strong expression in >50% of neoplastic cells. Rare, weak nuclear SALL4 expression was detected in only 3 nontesticular DLBCLs. Within the extratesticular DLBCL group, 2/6 (33%) primary CNS DLBCLs expressed nuclear OCT4. In addition, OCT4 DLBCL showed an overall predilection toward non-germinal center B-cell phenotype (7/8; 88%) and had a higher than expected rate of CD5 coexpression (4/8, 50%). These results are cautionary against using OCT4 as a sole marker of germ cell differentiation in testicular and extratesticular sites, especially in the CNS. The apparent associations of OCT4 expression with primary CNS DLBCL, non-germinal center B-cell phenotype, and CD5 coexpression raise the question of whether OCT4 expression in DLBCL may reflect more aggressive biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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