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Enregistrement W2326559171 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-2331

Abstract 2331: Role of MMP expression in the effect of Plk4 on cell migration and invasion

2011· article· en· W2326559171 sur OpenAlexaff
Volha Brashavitskaya, Carla O. Rosario, James W. Dennis, Carol J. Swallow

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMotilityCell biologyBiologyMatrigelCell migrationMolecular biologyCellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plk4 is a haploinsufficient tumor suppressor in mice (Ko et al, Nature Genetics, 2005). Plk4+/− mouse embryonic fibroblasts (MEFs) spontaneously immortalize in culture and become tumorigenic by passage 15 (Rosario et al, PNAS, 2010). We investigated the secondary genetic alterations associated with tumorigenicity. Early passage (P3) Plk4+/+, P3 Plk4+/− and late passage (P15) Plk4+/− MEFs were compared by genome-wide expression array (Illumina). When differentially expressed genes were organized by biological function, increased cell proliferation and death (p=2.13E10-1.31E02, p = 2.52E07-1.14E02 respectively), and decreased cell motility (p = 3.74E07-1.27E02) in the P15 MEFs were predicted. An independent array analysis comparing tumorigenic (T) to nontumorigenic (NT) Plk4+/− MEFs showed a pattern of altered gene expression predictive of decreased motility in the T MEFs. These results suggested the hypothesis that Plk4 modulates cell motility. To directly test this hypothesis in functional assays we measured cell spreading, scratch-wound healing and transwell migration through Matrigel; in all these assays P3 Plk4+/− were inferior to P3 Plk4+/+ MEFs. We hypothesized that altered MMP expression was one mechanism for the difference observed in migration, and tested this by comparing MMP-13,-10 and -3 expression as shown in the Table. Plk4 status was associated with altered expression of MMPs; in particular, MMP-13 expression was confirmed to be significantly reduced in P3 Plk4+/− compared to P3 Plk4+/+ MEFs by RT-qPCR. Our results indicate that Plk4 regulates cell motility and invasion. One potential mechanism is through upregulation of MMP-3,-10, and -13 expression. To further elucidate the molecular mechanisms of Plk4 related carcinogenesis we will next directly determine the effect of Plk4 on MMP activity and correlate this with migration and invasion. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 2331. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-2331

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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