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Enregistrement W2326960069 · doi:10.1158/1538-7445.am10-2243

Abstract 2243: Prognostic significance of nuclear Sox4 expression in cutaneous melanoma and its role in cell migration

2010· article· en· W2326960069 sur OpenAlexaff
Seyed Mehdi Jafarnejad, Aijaz Ahmed Wani, Magdalena Martinka, Gang Li

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSOX4Tissue microarrayCancer researchMelanomaGene silencingBiologyCancerImmunohistochemistryPathologyMedicineGene expressionOncologyInternal medicineImmunologyGenePromoterGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Sry-related high-mobility group (Sox) family of genes is consisted of transcription factors involved in various physiological processes including embryonic development, cell fate decision and differentiation. Deregulated expression of Sox4 has been reported in several human cancer types so far; nevertheless the expression and possible role of Sox4 in human melanoma cancer progression is yet to be identified. To investigate the putative role of Sox4 in the development of melanoma and its correlation with patient survival, we examined the expression of Sox4 protein in different stages of melanocytic lesions and its role in melanoma cancer cells proliferation and migration. Using tissue microarray and immunohistochemistry, we evaluated Sox4 protein expression in 43 dysplastic nevi, 89 primary melanomas, and 48 metastatic melanomas. We observed a marked reduction in nuclear Sox4 expression in malignant melanomas compared with dysplastic nevi (Kruskal-Wallis test; p < 0.05) and primary melanomas (Kruskal-Wallis test; p < 0.01). Moreover, the reduced nuclear Sox4 expression was significantly correlated with a poorer disease-specific 5-year survival of patients with primary and metastatic melanoma (Kaplan-Meier test; P = 0.039). Multivariate Cox regression analysis revealed that reduced nuclear Sox4 expression is an independent prognostic factor to predict patient outcome (p = 0.049). We also knocked down the expression of Sox4 in MMRU human melanoma cell line by siRNA and the migratory ability of the cells as well as their proliferation rate were analyzed following Sox4 silencing. Strikingly, the wound healing assay revealed an augmented migration ability of MMRU cells upon siRNA mediated knockdown of Sox4. However, the absence of Sox4 did not affect the rate of melanoma cancer cells proliferation. Our results suggest that Sox4 may be a suitable marker for the prognosis of the melanoma cancer outcome and a potential therapeutic target for human melanoma. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 2243.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
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