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Enregistrement W2327242544 · doi:10.1093/neuonc/nou206.16

SOX2 IDENTIFIES THE TREATMENT-REFRACTORY STEM CELL POPULATION IN GROUP 2 MEDULLOBLASTOMA

2014· article· en· W2327242544 sur OpenAlexaff
Shiv K. Singh, Branavan Manoranjan, Chitra Venugopal, Parvez Vora, Nicole McFarlane, Neha Garg, Mohini Singh, Aneet Mann, David Bakhshinyan, Sandra E. Dunn

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSonic hedgehogMedulloblastomaSOX2BiologyCancer researchCancer stem cellGLI1Gene knockdownChromatin immunoprecipitationStem cellHedgehog signaling pathwaySignal transductionApoptosisTranscription factorCell biologyGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Brain tumors represent the leading cause of childhood cancer mortality, of which medulloblastoma (MB) is the most frequent malignant pediatric brain tumor. Recent studies have demonstrated the presence of several MB molecular subgroups, each distinct in terms of prognosis and predicted therapeutic response. Although, group 2 MBs characterized by activation of the sonic hedgehog (Shh) signaling pathway have been of particular therapeutic interest, treatment-resistance has posed a significant challenge. Given the identification of brain tumor-initiating cells (BTICs), which have the ability to initiate and maintain tumor growth while promoting resistance to radio- and chemotherapy, we investigated the mechanistic profile of treatment-resistant Shh-dependent MB BTICs. METHODS: Through investigating a differential stem cell gene expression profile of 325 primary human MBs, followed by a subsequent series of step-wise knockdown, overexpression, chromatin immunoprecipitation (ChIP), and in vitro self-renewal analyses we assessed the mechanistic role of Sox2 as a novel downstream target of Shh effector proteins, Gli1 and Gli2. We further determined the clinical utility of this mechanism by treating our MB BTICs with conventional radio- and chemotherapy as per the Children's Oncology Group (COG) protocol for MB patients in order to assess the validity of Sox2 as a marker of Shh-dependent treatment-refractory MB BTICs. RESULTS: Activation and inhibition of the Shh pathway and Sox2 expression using small molecule Shh agonists and antagonists, respectively, were observed only in distinct subsets of tumor cells (CD15+ MB BTICs). ChIP experiments further demonstrated the presence of a differential Shh signaling mechanism within distinct cell populations of the bulk tumor mass as Gli proteins showed Sox2 promoter binding only in CD15+ MB BTICs. The functional relevance of this cell-specific signaling mechanism was assessed through an in vitro and in vivo increase in treatment-resistant Sox2+ MB BTICs following conventional and combinatorial radio- and chemotherapy with Shh pathway inhibitors. CONCLUSIONS: Our work demonstrates for the first time that Sox2 expression in MB is regulated by the Shh signaling pathway and Sox2+ MB BTICs represent the treatment-resistant clone in Group 2 MBs, suggesting a need for combinatorial therapy as tumors evolve over the course of treatment. Aside from implicating developmental genes and pathways in oncogenesis, we have also demonstrated the importance of studying cancer at a cellular level, as distinct differences in rare subsets of tumor cells may not otherwise be appreciated with genomic profiling of the bulk tumor mass. SECONDARY CATEGORY: Neuropathology & Tumor Biomarkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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