Total Synthesis and Antibacterial Testing of the A54556 Cyclic Acyldepsipeptides Isolated from <i>Streptomyces hawaiiensis</i>
Notice bibliographique
Résumé
The first total synthesis of all six known A54556 acyldepsipeptide (ADEP) antibiotics from Streptomyces hawaiiensis is reported. This family of compounds has a unique mechanism of antibacterial action, acting as activators of caseinolytic protease (ClpP). Assembly of the 16-membered depsipeptide core was accomplished via a pentafluorophenyl ester-based macrolactamization strategy. Late stage amine deprotection was carried out under neutral conditions by employing a mild hydrogenolysis strategy, which avoids the formation of undesired ring-opened depsipeptide side products encountered during deprotection of acid-labile protecting groups. The free amines were found to be significantly more reactive toward late stage amide bond formation as compared to the corresponding ammonium salts, giving final products in excellent yields. A thorough NMR spectroscopic analysis of these compounds was carried out to formally assign the structures and to aid with the spectroscopic assignment of ADEP analogues. The identity of two of the structures was confirmed by comparison with biologically produced samples from S. hawaiiensis. An X-ray crystallographic analysis of an ADEP analogue reveals a conformation similar to that found in cocrystal structures of ADEPs with ClpP protease. The degree of antibacterial activity of the different compounds was evaluated in vitro using MIC assays employing both Gram-positive and Gram-negative strains and a fluorescence-based biochemical assay.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».