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Enregistrement W2327446966 · doi:10.71781/4097

Caractérisation et évaluation de la virulence de souches cliniques de Clostridium perfringens chez le poulet à griller élevé sans antibiotique

2015· dissertation· fr· W2327446966 sur OpenAlexfundno aff
Éric Parent

Notice bibliographique

RevuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2015
Typedissertation
Languefr
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de Montréal
Mots-clésClostridium perfringensBiologyMicrobiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cette étude a développé un nouveau modèle aviaire de ligatures intestinales en boucles pour évaluer la virulence de souches de Clostridium perfringens causant l’entérite nécrotique chez le poulet. Des souches de C. perfringens caractérisées à partir d’une banque d’isolats récupérés de poulets à chair élevés sans antibiotique de fermes avec et sans problèmes d’entérite nécrotique ont été utilisées. La caractérisation des isolats de ces deux fermes a montré une faible diversité génétique parmi la ferme avec problèmes d’entérite nécrotique, alors que les isolats récupérés de la ferme sans entérite nécrotique a montré une haute diversité génétique. La détection de gènes de toxines a montré une prévalence de 95% pour le gène netB et 79% pour le gène cpb2 dans la ferme avec entérite nécrotique alors qu’elle était de 0% pour netB et 25% pour cpb2 dans la ferme sans entérite nécrotique. Dans le modèle de ligatures en boucles intestinales, les trois souches provenant de la ferme avec entérite nécrotique ont induit des lésions d’entérite nécrotique, alors que la souche provenant de la ferme sans entérite nécrotique a été incapable de reproduire l’entérite nécrotique. De plus, une souche netB négative et cpb2 positive provenant de la ferme avec entérite nécrotique a induit des lésions d’entérite nécrotique. Une association positive a aussi été observée entre la présence de lésions sévères et la localisation de larges bâtonnets à Gram-positif sur la muqueuse intestinale, suggérant que l’adhésion de C. perfringens à la muqueuse intestinale pourrait être importante dans la pathogénèse de l’entérite nécrotique. Ce modèle peut être utilisé pour étudier la virulence des souches de C. perfringens, en plus de montrer un fort potentiel pour étudier les interactions hôte-pathogène dans l’entérite nécrotique. Finalement, cette étude a montré que netB est un facteur de virulence important pour C. perfringens, mais non essentiel pour causer des lésions d’entérite nécrotique.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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