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Record W2327446966 · doi:10.71781/4097

Caractérisation et évaluation de la virulence de souches cliniques de Clostridium perfringens chez le poulet à griller élevé sans antibiotique

2015· dissertation· fr· W2327446966 on OpenAlexfundno aff
Éric Parent

Bibliographic record

VenuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2015
Typedissertation
Languagefr
FieldMedicine
TopicClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Canadian institutionsnot available
FundersNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de Montréal
KeywordsClostridium perfringensBiologyMicrobiologyBacteria

Abstract

fetched live from OpenAlex

Cette étude a développé un nouveau modèle aviaire de ligatures intestinales en boucles pour évaluer la virulence de souches de Clostridium perfringens causant l’entérite nécrotique chez le poulet. Des souches de C. perfringens caractérisées à partir d’une banque d’isolats récupérés de poulets à chair élevés sans antibiotique de fermes avec et sans problèmes d’entérite nécrotique ont été utilisées. La caractérisation des isolats de ces deux fermes a montré une faible diversité génétique parmi la ferme avec problèmes d’entérite nécrotique, alors que les isolats récupérés de la ferme sans entérite nécrotique a montré une haute diversité génétique. La détection de gènes de toxines a montré une prévalence de 95% pour le gène netB et 79% pour le gène cpb2 dans la ferme avec entérite nécrotique alors qu’elle était de 0% pour netB et 25% pour cpb2 dans la ferme sans entérite nécrotique. Dans le modèle de ligatures en boucles intestinales, les trois souches provenant de la ferme avec entérite nécrotique ont induit des lésions d’entérite nécrotique, alors que la souche provenant de la ferme sans entérite nécrotique a été incapable de reproduire l’entérite nécrotique. De plus, une souche netB négative et cpb2 positive provenant de la ferme avec entérite nécrotique a induit des lésions d’entérite nécrotique. Une association positive a aussi été observée entre la présence de lésions sévères et la localisation de larges bâtonnets à Gram-positif sur la muqueuse intestinale, suggérant que l’adhésion de C. perfringens à la muqueuse intestinale pourrait être importante dans la pathogénèse de l’entérite nécrotique. Ce modèle peut être utilisé pour étudier la virulence des souches de C. perfringens, en plus de montrer un fort potentiel pour étudier les interactions hôte-pathogène dans l’entérite nécrotique. Finalement, cette étude a montré que netB est un facteur de virulence important pour C. perfringens, mais non essentiel pour causer des lésions d’entérite nécrotique.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.007
Threshold uncertainty score0.015

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.000
Meta-epidemiology (broad)0.0010.001
Bibliometrics0.0010.000
Science and technology studies0.0000.001
Scholarly communication0.0010.001
Open science0.0000.001
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.018
GPT teacher head0.268
Teacher spread0.250 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2015
Admission routes1
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