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Enregistrement W2327641304 · doi:10.1249/01.mss.0000400803.25030.c3

Multi-color Immunofluorescence Procedure for Rapid Identification of MHC Expression in Human Skeletal Muscle

2011· article· en· W2327641304 sur OpenAlexaff
Darin Bloemberg, Joe Quadrilatero

Notice bibliographique

RevueMedicine & Science in Sports & Exercise · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyosinSkeletal muscleImmunofluorescencePopulationMolecular biologyGene isoformStainingAntibodyBiochemistryImmunoperoxidaseBiologyChemistryMonoclonal antibodyEndocrinologyGeneImmunologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously outlined an immunofluorescence staining protocol for evaluating the fiber type composition of rat and mouse skeletal muscles. The main advantage of this protocol compared to typical myosin ATPase and immunoperoxidase procedures is that multiple myosin heavy chain (MHC) isoforms can be identified on a single cross-section, eliminating the need for multiple incubations. Additionally, detection of MHC expression directly allows for more accurate fiber type identification as differential pH-dependant inactivation of myosin ATPase has been noted across species. However, antibody cross-reactivity with human muscle must also be considered. PURPOSE: To examine the effectiveness of a rapid immunofluorescence fiber-typing procedure on human skeletal muscle. METHODS: Cross-sections of vastus lateralis muscle from eight subjects were incubated with antibodies against MHCI (BA-F8), IIa (SC-71 or 2F7), and IIx (6H1). An additional antibody, specific for all MHC isoforms except IIx (BF-35) was also used. Fiber-type specific oxidative and glycolytic capacity was measured by metabolic enzyme activity staining for succinate dehydrogenase (SDH) and glycerophosphate dehydrogenase (GPD), respectively. RESULTS: Fibers demonstrating strong reactivity with BA-F8 were classified as type I (48.9%). A considerable number of fibers stained intensely for SC-71 and 2F7 and were classified as type IIA (42.8%). A very small subset of fibers stained intermediate for both BA-F8 and SC-71 and were classified as type I/IIA (0.1%). A population of fibers displayed reactivity against 6H1; however, this population also showed intermediate staining for both MHCIIa antibodies. These fibers were identified either as pure type IIX based on their non-reactivity with BF-35 (5.6%), or as type IIAX hybrid fibers based on intermediate staining for both 6H1 and BF-35 (2.6%). Type I fibers were observed as being most oxidative and type IIX fibers as being most glycolytic, with hybrid fibers displaying enzyme activity between their respective pure counterparts. CONCLUSIONS: These results suggest that a multi-color approach using three commercially available antibodies simultaneously is effective for identifying both pure and hybrid fibers in human muscle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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