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Enregistrement W2328028556 · doi:10.1097/pai.0000000000000082

CytoLyt® Fixation and Decalcification Pretreatments Alter Antigenicity in Normal Tissues Compared With Standard Formalin Fixation

2014· article· en· W2328028556 sur OpenAlexaff
Jennette Gruchy, Penny J. Barnes, Kelly A. Dakin Haché

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensCapital District Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBone decalcificationImmunohistochemistryFixation (population genetics)Chromogranin APathologyChemistryMedicineMolecular biologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immunohistochemistry is used on cell blocks constructed from cytopathology samples fixed in methanol-based fixatives, such as CytoLyt (Cytyc Corp), and on surgical pathology tissues exposed to decalcifying agents, often without technical validation. We evaluated a panel of commonly utilized antibodies in normal tissues exposed to differing preanalytic conditions as follows: CytoLyt fixation, formalin fixation followed by exposure to decalcifying agents (Leica Decalcifier I-10% formic acid or Leica Decalcifier II-5% hydrochloric acid), or standard formalin fixation. Altered expression was observed with several antibodies compared with standard formalin fixation. Specifically, there was absent or near absent expression of thyroid transcription factor 1 (TTF-1), D2-40, and CD20 in CytoLyt-fixed tissues, whereas reduced expression was observed for p63, estrogen receptor, S100 protein, CD3, calretinin, chromogranin, and synaptophysin. Absent or near absent expression of TTF-1 was also observed with exposure to hydrochloric acid, whereas reduced expression was observed for CK5/6, CK7, p63, estrogen receptor, leukocyte common antigen, CD3, CD20, and synaptophysin. Exposure to formic acid had less impact with reduced expression observed for only 3 antibodies (CK8/18, CK7, and TTF-1). The results of this study demonstrate the need to validate immunohistochemical protocols on control tissue treated in the same manner as test tissue, including CytoLyt fixation and exposure of tissue to decalcifying agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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