Surface Immobilization of Structure-Switching DNA Aptamers on Macroporous Sol−Gel-Derived Films for Solid-Phase Biosensing Applications
Notice bibliographique
Résumé
Structure-switching signaling aptamers (ss-aptamers) are single-stranded DNA molecules that are generated through in vitro selection and have the ability to switch between a duplex composed of a quencher-labeled DNA strand (QDNA) hybridized adjacent to a fluorophore label on the aptamer, and an aptamer-target complex wherein the QDNA strand is released, generating a fluorescence signal. While such species have recently emerged as promising biological recognition and signaling elements, very little has been done to evaluate their potential for solid-phase assays. In this study, we demonstrate that high surface area, sol-gel-derived macroporous silica films are suitable platforms for high-density affinity-based immobilization of functional ss-aptamer molecules, allowing for binding of both large and small target analytes with robust signal development. These films are formed using a poly(ethylene glycol) (PEG)-doped sodium silicate material, and we show that it is possible to control the pore size distribution and surface area of the silica film by varying the amount of PEG. Materials with the highest surface area are shown to be able to immobilize up to 6-fold more ss-aptamer than planar glass surfaces, providing greater detection sensitivity and somewhat improved detection limits as compared to immobilization on conventional glass. The solid-phase assay is performed using two different structure-switching signaling aptamers with high selectivity for adenosine 5'-triphosphate and platelet-derived growth factor, respectively, demonstrating that this immobilization scheme should be suitable for a variety of target ligands.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».