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Enregistrement W2330218855 · doi:10.1038/nmicrobiol.2016.27

Global phylogeography and evolutionary history of Shigella dysenteriae type 1

2016· article· en· W2330218855 sur OpenAlexaff
Elisabeth Njamkepo, Nizar Fawal, Alicia Tran-Dien, Jane Hawkey, Nancy Strockbine, Claire Jenkins, Kaisar A. Talukder, Raymond Bercion, Konstantin V. Kuleshov, R. Kolínská, Julie E. Russell, Л. А. Кафтырева, Marie Accou-Demartin, Andreas Karas, Olivier Vandenberg, Alison E. Mather, Carl J. Mason, Andrew J. Page, Thandavarayan Ramamurthy, Chantal Bizet, Andrzej Gamian, Isabelle Carle, Amy Gassama Sow, Christiane Bouchier, Astrid Louise Wester, Monique Lejay-Collin, Marie‐Christine Fonkoua, Simon Le Hello, Martin J. Blaser, Cecilia Jernberg, Corinne Ruckly, Audrey Mérens, Anne‐Laure Page, Martin Aslett, Peter Roggentin, Angelika Fruth, Érick Denamur, Malabi M. Venkatesan, Hervé Bercovier, Ladaporn Bodhidatta, Chien‐Shun Chiou, Dominique Clermont, Bianca Colonna, S. A. Egorova, Gururaja Perumal Pazhani, Analía V. Ezernitchi, Ghislaine Guigon, Simon R. Harris, Hidemasa Izumiya, Agnieszka Korzeniowska‐Kowal, Anna Lutyńska, Malika Gouali, Francine Grimont, Céline Langendorf, Monika Marejková, Lorea Peterson, Antoinette Ngandjio, А. Т. Подколзин, Erika Souche, М. А. Макарова, German A. Shipulin, Changyun Ye, Helena Žemličková, M Herpay, Patrick A. D. Grimont, Julian Parkhill, Philippe Sansonetti, Kathryn E. Holt, Sylvain Brisse, Nicholas R. Thomson, François‐Xavier Weill

Notice bibliographique

RevueNature Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésDysenterySmallpoxOutbreakPlague (disease)Shigella dysenteriaePhylogeographyBacillus anthracisGeographyCoalescent theoryBacillary dysenteryBiologyVirologyAncient historyHistoryGeneticsPhylogeneticsMicrobiologyVaccinationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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