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Enregistrement W2330266192 · doi:10.1021/bi501054b

Increasing Efficiency in Protein–Protein Coupling: Subunit-Directed Acetylation and Phase-Directed CuAAC (“Click Coupling”) in the Formation of Hemoglobin Bis-Tetramers

2014· article· en· W2330266192 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaUniversity of TorontoCanadian Blood Services
Mots-clésAzideTetramerChemistryProtein subunitPentamerAcetylationCombinatorial chemistryAllosteric regulationStereochemistryHemoglobinBiophysicsBiochemistryOrganic chemistryReceptorEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cross-linked human hemoglobins have been evaluated for clinical use as circulating oxygen carriers. However, their induction of vasoactivity was sufficiently problematic to lead to the cessation of clinical trials. The source of vasoactivity is likely to be endothelial extravasation causing the scavenging of endogenous nitric oxide. It was recently shown that species that consist of two coupled hemoglobin tetramers do not evoke vasoactivity in a sensitive murine model. Presumably these materials are too large to extravasate. In order to make this class of material more readily available, there is a need for improved methods that can form a cross-linked bis-tetramer without producing smaller species at the same time. A potentially efficient route to cross-linking and coupling two Hb tetramers is through phase-directed copper-catalyzed azide alkyne cycloaddition (PDCuAAC). However, introduction of the necessary azide-containing cross-link gives mixtures of tetrameric and bis-tetrameric proteins, as the PDCuAAC process appears to be limited to only those proteins where the cross-link containing the azide is exclusively within the β-subunits. In order to block formation of the azide cross-link within the α-subunits, subunit-specific introduction of the azide is necessary. This is achieved by blocking reaction at the reactive amino groups of the β-subunits in the site that binds the allosteric activator 2,3-diphosphoglycerate (DPG) with inositol hexaphosphate (IHP), permitting α-selective acetylation with acetyl 3,5-dibromosalicylate. After removal of IHP, reaction with an anionic cross-linker containing an azide group occurs within the β-subunits. The resulting α-acetylated β-β'-cross-linked hemoglobin azide (acHb>-N3) undergoes efficient PDCuAAC with bis-alkynes to produce cross-linked bis-tetramers. Analysis of circular dichroism spectra of the modified species shows that there is little change in the structure of the globin chains as a result of the chemical modifications. The oxygenation properties are consistent with those needed for effective oxygenation in circulation, while the bis-tetrameric structure is sufficiently large to avoid extravasation and depletion of nitric oxide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,755

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle