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Enregistrement W2331918424 · doi:10.1021/bi101281f

Transmembrane Helix I and Periplasmic Loop 1 of <i>Escherichia coli</i> ProP Are Involved in Osmosensing and Osmoprotectant Transport

2010· article· en· W2331918424 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPeriplasmic spaceSymporterTransmembrane domainBiochemistryMajor facilitator superfamilyTransmembrane proteinChemistryOsmoprotectantEscherichia coliBiologyBiophysicsAmino acidMutantTransporterProlineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osmoregulatory transporters stimulate bacterial growth by mediating osmoprotectant uptake in response to increasing osmotic pressure. The ProP protein of Escherichia coli transports proline and other osmoprotectants. Like LacY, ProP is a member of the major facilitator superfamily and a H(+)-solute symporter. ProP is regulated by osmotic pressure via a membrane potential-dependent mechanism. A homology model predicts that ionizable and polar residues, highly conserved among ProP homologues, cluster deep within the N-terminal helix bundle of ProP. Chemical labeling of introduced cysteine (Cys) residues supported the homology model by confirming the predicted positions of transmembrane helix I (TMI) and periplasmic loop 1. Replacements of residues in the putative polar cluster impaired or altered ProP function, suggesting that they are important for osmosensing and may interact with the transport substrates. Asn34, Glu37, Phe41, Tyr44, and Ala48 line the most polar face of TMI; Tyr44 is on the periplasmic side of the putative polar cluster, and Ala59 is in periplasmic loop 1. The N-ethylmaleimide reactivities of Cys introduced at positions 41, 44, 48, and 59 increased with osmotic pressure, whereas the reactivities of those at cytoplasm-proximal positions 34 and 37 did not. Replacements of polar cluster residues that blocked transport also affected the NEM reactivity of Cys44 and its osmolality dependence. This report and previous work suggest that conformational changes associated with osmosensing may shift the equilibria between outward- and inward-facing transport pathway intermediates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,713

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle