Transmembrane Helix I and Periplasmic Loop 1 of <i>Escherichia coli</i> ProP Are Involved in Osmosensing and Osmoprotectant Transport
Notice bibliographique
Résumé
Osmoregulatory transporters stimulate bacterial growth by mediating osmoprotectant uptake in response to increasing osmotic pressure. The ProP protein of Escherichia coli transports proline and other osmoprotectants. Like LacY, ProP is a member of the major facilitator superfamily and a H(+)-solute symporter. ProP is regulated by osmotic pressure via a membrane potential-dependent mechanism. A homology model predicts that ionizable and polar residues, highly conserved among ProP homologues, cluster deep within the N-terminal helix bundle of ProP. Chemical labeling of introduced cysteine (Cys) residues supported the homology model by confirming the predicted positions of transmembrane helix I (TMI) and periplasmic loop 1. Replacements of residues in the putative polar cluster impaired or altered ProP function, suggesting that they are important for osmosensing and may interact with the transport substrates. Asn34, Glu37, Phe41, Tyr44, and Ala48 line the most polar face of TMI; Tyr44 is on the periplasmic side of the putative polar cluster, and Ala59 is in periplasmic loop 1. The N-ethylmaleimide reactivities of Cys introduced at positions 41, 44, 48, and 59 increased with osmotic pressure, whereas the reactivities of those at cytoplasm-proximal positions 34 and 37 did not. Replacements of polar cluster residues that blocked transport also affected the NEM reactivity of Cys44 and its osmolality dependence. This report and previous work suggest that conformational changes associated with osmosensing may shift the equilibria between outward- and inward-facing transport pathway intermediates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».