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Enregistrement W2332145434 · doi:10.1093/neuonc/nou278.10

TM-10 * ALTERATIONS IN METABOLIC PATHWAYS IN GLIOBLASTOMA MULTIFORME CELLS IN RESPONSE TO HEXOKINASE-2 INHIBITION

2014· article· en· W2332145434 sur OpenAlexaff
Sushil Kumar, Shahrzad Jalali, A. Vartanian, Sameer Agnihotri, Kelly Burrell, Gelareh Zadeh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycolysisGene knockdownPentose phosphate pathwayMetabolic pathwayCitric acid cycleGliomaHexokinaseAnaerobic glycolysisBiologyMetabolomicsBiochemistryCancer researchChemistryCell biologyMetabolismApoptosisBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: GBMs are characterized by elevated glycolysis, however to date effective therapies targeting tumor glycolysis have not been identified. Also, the contribution of metabolic pathways other than glycolysis, such as glutamine and fatty acid oxidation, that are key in providing carbon to TCA cycle, have not been explored in GBMs. Aim: In this study we aim to decipher the adaptive mechanisms brought about by the inhibition of tumor glycolysis in GBMs. We have investigated the metabolic changes occurring in GBM cells after the knockdown of key glycolytic enzyme, hexokinase2 (HK2). METHODS AND RESULTS: We have generated doxycyclin-inducible HK2 knockdown GBM cells by transfecting shRNA in U87 and three Glioma Stem Cell lines with different baseline molecular characteristics We confirm specific knockdown of HK2, with no change in HK1 or HK3, using western blot. HK2 knockdown reduced cell number and proliferative capacity, in addition to decrease in lactate production and O2 consumption. HK2 loss significantly increased NADP:NADPH ratio. Metabolic profiling by LC/MS targeted metabolomics was conducted after exposing GBM cells to C13-labeled glucose media. LC/MS metabolomics demonstrate that decrease in HK2 significantly reduced the levels of metabolites belonging to glycolysis and Pentose Phosphate Pathway. These two pathways are known to be associated with NADPH and biomass production for rapidly proliferating tumor cells. In contrast, metabolites in TCA cycle increased in response to HK2 inhibition. CONCLUSION: Our data strongly suggests that GBM cells activate alternate metabolic pathways in response to inhibition of HK2 dependent glycolysis. These results have important clinical implications in designing combinatorial targeted therapy for blocking tumor metabolism in GBMs. Our ongoing work is focused on establishing the metabolites involved in glutamine catabolism and fatty acid oxidation, both in-vitro and in-vivo GBM models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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