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Enregistrement W2333268966 · doi:10.17952/24aps.2015.249

Structure-Based Optimization of a Potent PACE4 Inhibitor Containing a Decarboxylated P1 Arginine Mimetic

2015· article· en· W2333268966 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchProstate Cancer CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésLeucineBiochemistryChemistryArgininePeptideAmino acidIsoleucineCyclic peptideStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our recent studies have provided direct evidence for the critical role of PACE4 in the progression of prostrate cancer, identifying this enzyme as a promising target to design novel and effective treatments [1]. Moreover, we developed a potent PACE4 inhibitor with considerable selectivity (20-fold over furin) known as the Multi-Leu (ML) peptide [2]. In order to improve its pharmacological profile, we performed structure-activity relationship (SAR) studies and determined that the incorporation of the decarboxylated arginine mimetic (4-amidinobenzylamide, Amba) at the P1 position led to a more potent and stable analog [3]. Unfortunately, this inhibitor suffered from a reduced selectivity towards PACE4. To restore its specificity profile, we used a positional-scanning approach and synthesized peptide libraries by substituting each amino acid residue in the leucine core of our inhibitor. These studies revealed that we are able to enhance the specificity profile (3-fold) and preserve the inhibitory activity as well as antiproliferative properties of our inhibitor by incorporating a leucine isomer – L-isoleucine into its structure (Maluch, et al., unpublished data). Based on these results, we decided to perform further SAR studies aiming to improve the specificity and activity of our MLAmba inhibitor. We focused on the leucine core (P8-P5) and its modification with unnatural amino acid residues possessing hydrophobic character (Figure 1). First we evaluated the impact of a single substitution (from the P8 to P5 position) on the inhibitory activity of the resulting peptides, and then we combined the most promising modifications. In this work, we present the synthesis and biological evaluation of a new series of MLAmba analogs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,427

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle