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Enregistrement W2334495433 · doi:10.1158/0008-5472.sabcs-09-4078

High Frequency of BRCA1 Founder Mutations in the Bahamas.

2009· article· en· W2334495433 sur OpenAlexaff
Talia Donenberg, John Lunn, Theodore Turnquest, D. Curling, Elisa Krill-Jackson, Robert E. Royer, Steven A. Narod, Judith Hurley

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFounder effectBreast cancerOvarian cancerMutationPopulationGeneticsFamily historyCancerDemographyMedicineBiologyInternal medicineGenotypeHaplotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The frequency of mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes differs among ethnic groups, due to regional founder effects. The Bahamas is an island nation of 305,000 people, with a complex history of immigration from the 1600s-1800s including English, Americans and African slaves. An initial survey by our group demonstrated that 48% of breast cancers in the Bahamas are diagnosed in women under 50 suggesting an inherited cause for many. In a follow up study, we identified four distinct BRCA1 mutations in 9 of 19 high risk Bahamian breast and ovarian cancer families (47.36%). A fifth mutation has been previously published in a Bahamian family and is a confirmed African founder mutation. In the current study, we sought to estimate the prevalence of these mutations among unselected breast and ovarian cancer patients from the Bahamas. We have enrolled 135 unrelated women with breast (n = 133) or ovarian cancer (n=2) attending public and private clinics in the Bahamas and Miami. A detailed family history was obtained from each patient and a saliva sample was obtained for DNA analysis. DNA samples were tested by mutation specific assay for the presence of five BRCA1 mutations (IVS13+1G>A, M1775R, IVS16+6A>C, 4730insG and 943ins10). Twenty-three mutations were detected, representing 17% mutation prevalence in this population, including IVS13+1G>A (14 times), IVS16+6A>C (two times), M1775R (three times), 4730insG (three times) and 943ins10 (once). This reflects a very high rate of genetic breast cancer in this population with a strong founder effect. This important finding raises the possibility of developing an inexpensive genetic screen for inherited susceptibility to breast cancer in the Bahamas and the need to mount an effective cancer prevention strategy for this population at high risk. Citation Information: Cancer Res 2009;69(24 Suppl):Abstract nr 4078.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,409
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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