ALDH1 is a useful marker of basalness in human breast cancer and its stem/progenitor cells.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Abstract #104 Background: The basal cell subtype is a particularly aggressive form of breast cancer. The molecular mechanisms which underlie the aggressive course of basal cell breast cancer, as well as its corresponding tumor markers are currently under intense study. In addition, there is increasing evidence that cancer stem/progenitor cells are integral to the formation and perpetuation of breast cancer. Together with their progenitors, cancer stem cells may determine the therapeutic outcome and the clinical course of cancer. The first isoform of aldehyde dehydrogenase (ALDH1) has recently been reported to be a marker of breast stem/progenitor cells. Thus, we undertook this study to determine whether the immunohistochemical detection of ALDH1 in fixed breast cancer tissues correlates with selected basal and luminal cell surface markers. Methods: Formalin-fixed, paraffin-embedded specimens were studied in triplicate using tissue microarrays from 57 breast cancer patients. In addition to ALDH1 staining, each of the following markers were studied using immunohistochemistry (IHC) in each sample: ER, PR, HER-2, the basal cell markers EGFR/HER1, CK5, CK14, CK17, SMA, and the luminal cell markers CK19, and EMA. Results: ALDH1 staining was performed using IHC and subsequently evaluated using the Quick score. The Quick score takes into account both the percentage of positive cells, as well as the corresponding staining intensity. Our results suggest that breast cancer samples expressing the triple negative phenotype (ER-, PR-, HER-2 negative) together with one or more basal cell markers (EGFR/HER1,CK5, CK14, CK17, SMA) are associated with an elevated Quick score for ALDH1 staining, when compared with samples lacking the expression of these markers. Conclusions: As it has been demonstrated that IHC detection of ALDH1 detects stem/progenitor cells in fixed breast samples, our results suggest that an elevated Quick score is associated with the enrichment of IHC basal cell markers in these samples. We are currently focusing on a larger number of breast cancer samples so that correlations can be studied as a function of therapeutic outcome and overall survival of breast cancer patients. Citation Information: Cancer Res 2009;69(2 Suppl):Abstract nr 104.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».