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Enregistrement W2336100438 · doi:10.1093/neuonc/nov209.42

CBIO-42DOWN REGULATION OF PYRUVATE DEHYDROGENASE ACTIVITY IS ESSENTIAL FOR CELL PROLIFERATION IN IDH1 MUTANT GLIOMA CELLS

2015· article· en· W2336100438 sur OpenAlexaff
Pavithra Viswanath, José Luis Izquierdo-García, Pia Eriksson, Larry Cai, Marina Radoul, Myriam M. Chaumeil, Michael Blough, H. Artee Luchmann, Samuel Weiss, J. Gregory Cairncross, Joanna J. Phillips, Russell O. Pieper, Sabrina M. Ronen

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantPyruvate dehydrogenase complexGliomaIDH1Isocitrate dehydrogenaseChemistryCell growthCell biologyBiochemistryCellEnzymeBiologyCancer researchGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Somatic mutations in the isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1) gene occur in 70-90% of low-grade gliomas. The mutation leads to the production of 2-hydroxyglutarate (2-HG), a novel “oncometabolite” that alters the epigenetic profile of DNA and inhibits cellular differentiation. Recent studies indicate that metabolic changes in IDH1 mutant cells extend beyond 2-HG production. We recently demonstrated that steady state levels of glutamate, lactate and phosphocholine were reduced in IDH1 mutant cells using two genetically engineered models, a U87 glioblastoma-based model and a normal human astrocyte (NHA) model. In this study, we explored the mechanism behind the reduction in glutamate levels in IDH1 mutant cells. We discovered that pyruvate dehydrogenase (PDH) activity was significantly reduced in U87 and NHA IDH1 mutant cells compared to wild-type cells. Reduced PDH activity was associated with increased inhibitory phosphorylation of PDH in both models. Examination of mRNA and protein levels for the pyruvate dehydrogenase kinases (PDKs) revealed that PDK3 expression was up-regulated in IDH1 mutant cells in both models. Levels of hypoxia inducible factor-1α (HIF-1α), an established regulator of PDK3 expression in cancer cells, was also higher in IDH1 mutant cells. Importantly, treatment of U87 and NHA IDH1 wild-type cells with 2-HG recapitulated the effects of the IDH1 mutation, with higher levels of HIF-1α and PDK3, and reduced PDH activity, in 2-HG treated cells. Importantly, pharmacological activation of PDH activity by treatment with dichloroacetate, a PDK inhibitor, completely abrogated the increase in clonogenicity conferred by the IDH1 mutation. Treatment of patient-derived mutant IDH1 neurosphere models (BT142 and BT54 cell lines) with dichloroacetate further confirmed that PDH activity is essential for cell proliferation. Thus, our results indicate that reversing the down regulation of PDH activity in IDH1 mutant glioma cells adversely affects their proliferation, a finding with therapeutic implications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
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