MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2336540863 · doi:10.1016/j.jalz.2015.07.016

F1‐03‐03: Mapping the progression of CSF and imaging biomarkers in “at‐risk” healthy subjects: The prevent‐ad program

2015· article· en· W2336540863 sur OpenAlexaff
Judes Poirier, Anne Labonté, Dorothy Dea, Jennifer Tremblay‐Mercier, Mélissa Savard, Pedro Rosa‐Neto, Pierre Étienne, Pierre Bellec, John C.S. Breitner

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBioinformatics and Genomic Networks
Établissements canadiensInstitut Universitaire de Gériatrie de MontréalDouglas Mental Health University InstituteDouglas CollegeMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApolipoprotein ECerebrospinal fluidBiomarkerGenotypeCohortInternal medicineMedicineOncologyResting state fMRIPathologyPsychologyDiseaseNeuroscienceBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increasing evidence suggests that multiple cerebrospinal fluid (CSF) and imaging biomarkers may elucidate the pre-symptomatic phase of Alzheimer's disease (AD). Using a cohort of aging cognitively intact individuals with a first-degree family history of AD, we evaluated time course alterations in multiple AD biomarkers including “classic” CSF markers and lipid transport proteins in relation to brain resting-state network activity. We examined results across specific genotypes including APOE. Baseline, 3-, 12- and 24-months data were acquired for an ongoing prevention trial nested in the PREVENT-AD program. CSF was obtained by lumbar puncture, and protein concentrations were measured using Innotest technology for tau, P-tau and Aβ1-42. Luminex-based immunoassays (Millipore) were used to quantify CSF apolipoproteins A1, A2, B, C2, C3 and E. Genotypes for APOE and other polymorphisms were determined using standardized pyrosequencing techniques. Finally, a systematic analysis of different resting state functional MRI-derived indices was performed using standard machine learning algorithms. The resulting signal was then examined in relation to alteration in P-tau at 12 months vs. baseline. Time course analyses of tau, P-tau and Aβ1-42 over 2 years indicated strong APOE-e4 genotype-driven differences at baseline, with a clear exacerbation of pathological changes between 12 and 24 months. The latter elevation in tau/Aβ1-42 ratio (n=60) found among APOE-e4 carriers vs. non-carriers was inapparent, however, in subjects with the protective (G-negative) genotype at the HMGCR rs3866662 locus. Surprisingly, levels of CSF apoE protein correlated directly with age, a finding driven by results from e4-negative subjects only (p<0.002). Levels of CSF apoB (derived exclusively from blood) were significantly increased in e4 carriers vs. non-carriers at all timepoints (p<0.01). Resting state network activity connecting precuneus to anterior cingulate cortex correlated inversely with P-tau change between baseline and 12 months (p <0.01). Alterations over time in tau, Aβ1-42 and P-tau levels in the CSF in a cohort of high-risk cognitively intact subjects suggest ongoing “silent” neurodegeneration with consequences for at least one specific network function. Our findings with apoB suggest loss of blood-brain barrier integrity in persons with APOE e4 – a group with other signs of exaggerated pre-symptomatic AD pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & DementiaMême sujetBioinformatics and Genomic NetworksTravaux en français237 207