IGHV1-69 polymorphism modulates anti-influenza antibody repertoires, correlates with IGHV utilization shifts and varies by ethnicity
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
IGHV polymorphism provides a rich source of humoral immune system diversity. One important example is the IGHV1-69 germline gene where the biased use of alleles that encode the critical CDR-H2 Phe54 (F-alleles) to make broadly neutralizing antibodies (HV1-69-sBnAb) to the influenza A hemagglutinin stem domain has been clearly established. However, whether IGHV1-69 polymorphism can also modulate B cell function and Ab repertoire expression through promoter and copy number (CN) variations has not been reported, nor has whether IGHV1-69 allelic distribution is impacted by ethnicity. Here we studied a cohort of NIH H5N1 vaccinees and demonstrate for the first time the influence of IGHV1-69 polymorphism on V-segment usage, somatic hypermutation and B cell expansion that elucidates the dominance of F-alleles in HV1-69-sBnAbs. We provide evidence that Phe54/Leu54 (F/L) polymorphism correlates with shifted repertoire usage of other IGHV germline genes. In addition, we analyzed ethnically diverse individuals within the 1000 genomes project and discovered marked variations in F- and L- genotypes and CN among the various ethnic groups that may impact HV1-69-sBnAb responses. These results have immediate implications for understanding HV1-69-sBnAb responses at the individual and population level and for the design and implementation of "universal" influenza vaccine.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle