Filamentous phage as a model immunogen for tracking B-cell responses to infection and vaccination (154.30)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Humoral immunity to infection can be categorized into four response stages: (i) innate-like, (ii) early-induced, (iii) adaptive, and perhaps (iv) the response to chronic infection (ChI). The first three stages are mediated by B-cell lineages distinguishable by phenotypic, genetic and functional characteristics. Our analysis of antibodies (Abs) produced during ChI indicates that “ChI Abs” have unique genetic features including high somatic mutation (SM) and usage of distal germline VH genes; ChI is also associated with aberrations in B-cell subsets. Here, we use filamentous phage as a model antigen to determine the genetic features and cellular origins of “ChI Abs” in the mouse. The phage’s surface consists of ~3,000 copies of the major coat protein, pVIII, and a majority of the anti-phage Ab response cross-reacts with a 12-aa peptide comprising the N-terminus of pVIII, allowing easy isolation of phage-specific B cells. After a single immunization, two “waves” of Ab-secreting cells (ASCs) appeared: first, IgM and IgG ASCs expressing proximal unmutated genes, followed by IgG ASCs expressing more distal genes bearing SMs. Phage-specific ASCs and serum IgG increased with repeated immunization, peaking after the fifth immunization and declining thereafter. Thus, we have validated the approach of combining cellular, flow cytometric, serological and immunogenetic analyses to characterize the dynamics of the B-cell response after initial and repeated encounter with antigen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».