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Enregistrement W2341105581 · doi:10.7287/peerj.preprints.1985v1

Mitochondrial DNA suggests recent origins in two coastal avian subspecies in northwestern North America

2016· preprint· en· W2341105581 sur OpenAlexaff
Rebecca G. Cheek, Kyle K. Campbell, Robert W. Dickerman, Berry Wijdeven, Kevin Winker

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMinistry of Forests
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubspeciesGenetic divergenceArchipelagoBiologyAllopatric speciationPopulationEcologyPhylogeographyGenetic diversityMitochondrial DNAEvolutionary biologyEndemismGeographyZoologyPhylogeneticsDemographyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic studies of subspecies endemic to Haida Gwaii (Queen Charlotte Islands), British Columbia and the Alexander Archipelago of southeast Alaska have frequently found genetic corroboration for these phenotypically based taxa. Divergence and speciation are common among island populations of birds, and evidence suggests this region has fostered such divergence during previous glacial maxima. We examined genetic divergence in mitochondrial DNA (mtDNA) of two coastal subspecies endemic to this region: sharp-shinned hawk ( Accipiter striatus perobscurus ) and great blue heron ( Ardea herodias fannini ). Genetic diversity in both species was remarkably low, with both coastal subspecies possessing only the most common haplotype found in continental populations. We found low but significant population divergence between A. s. perobscurus and continental populations of sharp-shinned hawks and no significant population divergence in the herons. The refugial history of the region suggests that these subspecies may have arisen relatively recently compared with other regional endemics for which genetic and phenotypic data both show divergence. Alternatively, species-wide selective sweeps of mtDNA prior to divergence may have rendered this genetic marker less useful for tracking that divergence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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