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Enregistrement W2341542952 · doi:10.5818/1529-9651-26.1-2.46

An Overview of Reptile Fungal Pathogens in the Genera Nannizziopsis, Paranannizziopsis, and Ophidiomyces

2016· article· en· W2341542952 sur OpenAlexaff
Jean A. Paré, Lynne Sigler

Notice bibliographique

RevueJournal of Herpetological Medicine and Surgery · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueTurtle Biology and Conservation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyFungal diseaseMicrobiologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Two recent molecular analyses of morphologically similar fungal isolates formerly grouped under the appellation “ Chrysosporium anamorph of Nannizziopsis vriesii (CANV) complex” led to major taxonomic revisions and revealed new insights into the biology of these reptile pathogens. All CANV-complex isolates differed from N. vriesii and were assigned to 16 species, either within Nannizziopsis or within the new genera Paranannizziopsis and Ophidiomyces , and 14 of these species were newly described. From these revisions, a trend in host specificity clearly emerged that was not previously apparent. Nannizziopsis now includes nine species associated with chamaeleonid, gekkonid, cordylid, teiid, agamid, and iguanid lizards; crocodiles; and human hosts. Paranannizziopsis includes four species that infect squamates and tuataras. Ophidiomyces , with the single species Ophidiomyces ophiodiicola (formerly Chrysosporium ophiodiicola ), is only associated with terrestrial or semiaquatic snakes. Nannizziopsi guarroi (formerly Chrysosporium guarroi ) is the main causal agent of yellow fungus disease in captive bearded dragons ( Pogona vitticeps ), and O. ophiodiicola is the cause of mycoses in captive snakes and of snake fungal disease, an emergent global threat to populations of endangered wild snakes. Histopathology, polymerase chain reaction assays, and culture are crucial for confirming a diagnosis of fungal infection in reptiles; however, because fungal identification based on morphologic and physiologic features alone is difficult, sequencing should be sought to speciate reptile fungal isolates. Information gathered from PCR assays and molecular speciation will help in outlining pathogenic potential and contagion risks associated with each of these newly recognized fungal species and allow for a more comprehensive understanding of the ecology, distribution, and host range of these pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0100,005
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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