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Enregistrement W2343174409 · doi:10.1186/s12977-016-0265-x

Effect on HIV-1 viral replication capacity of DTG-resistance mutations in NRTI/NNRTI resistant viruses

2016· article· en· W2343174409 sur OpenAlexafffund
Hanh Thi Pham, Thibault Mésplède, Mark A. Wainberg

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésIntegraseVirologyDolutegravirViral replicationReverse transcriptaseMutantBiologyMutationResistance mutationPlasmidIntegrase inhibitorVirusViral loadDNAHuman immunodeficiency virus (HIV)GeneticsPolymerase chain reactionGeneAntiretroviral therapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recommended regimens for HIV-positive individuals include the co-administration of dolutegravir (DTG) with two reverse transcriptase inhibitors (RTIs). Although rare, emerging resistance against DTG is often associated with the R263K substitution in integrase. In-vitro-selected R263K was associated with impaired viral replication capacity, DNA integration, and integrase strand-transfer activity, especially when accompanied by the secondary mutation H51Y. Given the reduced fitness of RTI-resistant viruses, we investigated potential impacts on viral replication of combining R263K and H51Y/R263K with major RTI-resistance substitutions including K65R, L74V, K103N, E138K, and M184I/V. RESULTS: We combined the R263K or H51Y/R263K with RTI-resistance mutations into the proviral plasmid pNL4.3 and measured the resulting viral infectiousness, replication capacity, and ability to integrate viral DNA into host cells. Infectiousness was determined by luciferase assay in TZM-bl cells. Replicative capacity was monitored over 7 days and viral DNA integration was studied by real-time Alu-qPCR in PM1 cells. We found that viral infectiousness, replication capacities and integration levels were greatly reduced in triple mutants, i.e. H51Y/R263K plus a RT mutation, and moderately reduced in double mutants, i.e. R263K plus a RT mutation, compared to wild-type and single RT-mutant viruses. CONCLUSIONS: Our findings help to explain the absence of RTI mutations in individuals who experienced DTG-treatment failure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,413

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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