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Enregistrement W2345878754 · doi:10.1093/jxb/erw144

Answering a four decade-old question on epicuticular wax biosynthesis

2016· letter· en· W2345878754 sur OpenAlexaff
Dylan K. Kosma, Owen Rowland

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2016
Typeletter
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Surface Properties and Treatments
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research Council
Mots-clésCutinWaxCuticle (hair)Plant cuticleEpicuticular waxBotanyBiologyChemistryBiochemistryAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this issue of Journal of Experimental Botany (pages 2715–2730) Schneider et al. report the identity of three genes from barley described in the 1970s as important for the synthesis of β-diketone cuticular waxes, thereby revealing a novel polyketide synthase pathway responsible for their production. It is a perfect example of how modern sequencing technologies can resolve age-old questions on important food crops. All land plants possess a lipophilic layer coating their aerial surfaces: a cuticle. It consists of waxes embedded within and overlaying an esterified polymer of oxygenated fatty acids and glycerol (cutin). As such, plant cuticles form one of the largest biological interfaces on the planet, providing the first points of contact with the surrounding, often hostile, environment. The key function of cuticle is to prevent non-stomatal water loss, but other functions include defense against bacterial and fungal pathogens, mediating interactions with insects, and protection from excess levels of ultraviolet radiation. Cuticular waxes are chemically complex mixtures of hydrophobic molecules, most typically even and odd chain fatty acid derivatives of carbon lengths C24 and higher. Epicuticular waxes form the outermost layer of cuticle and often form crystals, imparting a whitish bloom to the organ surface. The amount and composition of cuticular wax varies widely between plant species and even between organs of the same plant; and cuticle chemistry can also change during development of the organ and is altered by environmental conditions. β-diketones are very-long-chain (typically C29–C31) oxygenated hydrocarbons that have long been known to be cuticular wax components of some plants (Horn and Lamberton, 1962; Tulloch and Weenink, 1966; Jackson, 1971; von Wettstein-Knowles, 1972; Evans et al., 1975; Jenks et al., 2002). They are well described in the cuticular waxes of diverse plant species, including Eucalyptus, Rhododendron and Hosta. However, they are best described in graminaceous species (e.g. barley, wheat and oats) (Box 1). Knowledge of β-diketone biosynthesis has come from extensive genetic and radiotracer feeding studies in barley by Penny von Wettstein-Knowles and colleagues (von Wettstein-Knowles, 1995; 2012). The largest collection of cuticular wax-deficient mutants, termed eceriferum (cer), is in barley, consisting of more than 1500 mutants in about 75 complementation groups. The Cer-cqu cluster, which affects β-diketone, hydroxy β-diketone and esterified alkan-2-ol production, is represented by over 500 distinct mutations and is made up of three complementation groups (Cer-c, -q and -u) (Box 1). The identities of the genes in this locus have remained elusive – until now. Box 1. Epicuticular waxes of barley flag leaf sheaths (A) Wild type (WT) barley ‘Bonus’ and cer-c, cer-q, and cer-u mutants demonstrating the glossy phenotypes of the cer-c and cer-q mutants plus reduced wax on the cer-u mutant resulting from reductions in β-diketones and their derivatives. ...

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,549
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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