Cloning and Sequence Analysis of Genome of Porcine Circovirus Type 2
Notice bibliographique
Résumé
According to the published genomic sequences of porcine circovirus type 2(PCV2) in GenBank,a pair of specific primers were designed and synthesized to amplify the full-length genomic sequence of PCV2 HBZX strain from clinically suspected postweaning multisystemic wasting syndrome(PMWS) samples,the PCR product was cloned and sequenced.The results showed that the length of genomic sequence of PCV2 HBZX strain was 1 767nt.There was a 95.0%～98.9% nucleotide identity between the genome sequence of HBZX strain and other PCV2 isolates in GenBank.The phylogenetic analysis of the genomic sequence and the ORF2 sequences showed the similar phylogenetic tree.Phylogenetic-ally,PCV2 could be divided into two major subtypes,PCV2-subtype 1 and PCV2-subtype 2.The isolates from Asia(represented by China strain) grouped with the isolates from America(represented by Canada strain) distributed in subtype 1,the isolates from Europe(represented by France strain) distributed in subtype 2.It was concluded that there was correlation between PCV2 isolates and geographic regions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».