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Enregistrement W2350006663

Expression and purification of catalytic domain of human macrophage elastase for high throughput inhibitor screening.

2002· article· en· W2350006663 sur OpenAlexaff
Qiang Shen, Jing Qian, Zhen Qian, Qi Zhuang Ye

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHigh-throughput screeningRecombinant DNAChemistryElastaseBiochemistryEnzymeIn vitroEscherichia coliInclusion bodiesGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To obtain a catalytically active human macrophage elastase catalytic domain (hMECD) and to establish an efficient high-throughput method for screening macrophage elastase inhibitors. METHODS: Catalytic domain of human macrophage elastase was expressed in E coli and characterized to establish a high-throughput screening assay using a colorimetric method. A set of 8560 pure compounds and mixtures were screened. RESULTS: We have constructed an efficient E coli system for this human protein expression, and the recombinant hMECD protein was purified to homogeneity using anion-exchange chromatography after in vitro refolding from inclusion bodies. The yield of active hMECD protein was 23 mg from one liter of E coli culture after purification. Calcium and zinc ions were required both in refolding and enzymatic activity, but high concentration of zinc inhibited the refolding and activity. The hMECD cleaved several synthetic substrates including a chromogenic thiopeptolide and fluorogenic peptides with optimal activity around pH 8.0. Screening of 8560 compounds and mixtures led to identify 27 pure compounds and 14 natural products with inhibitory activity higher than 80 % at 20 mg/L. CONCLUSION: An efficient expression and purification method for hMECD protein has been established, and the assay is effective, reliable, and fast in identifying the recombinant protein inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,294

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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