Design of SSR Primers and Verification of E-PCR in Non-coding Regions of Sorghum Genome
Notice bibliographique
Résumé
The complete genome sequence of sorghum which downloaded from the NCBI public databases was used for a simple sequence repeated SSR search.The result showed that there were 87950 SSR loci and 1134 kinds of repetition about the results in all.The proportion of dinucleotide and trinucleotide repeats was placed on the first place,accounting for 43.36% and 32.38% of the all.SSR primers of sorghum were designed basing on the search results of SSR,according to use the e-PCR to validate and screen primers two times,50 pairs of primers were arbitrarily selected and synthesized to evaluate these primers by sorghum-sudangrass hybrids such as Xian-Feng and Le-Shi.The results showed that there were 46 target bands among 50 pair primer,and the target bands were characterized clearly and steadily,of which only 8 pairs had polymorphism.It indicated that the polymorphism of sorghum designed primers in non-coding region was not higher than the EST-SSR primers,but it played a complementary and catalytic role on the development of SSR primers in sorghum.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».