Establishment and optimization of RAMP-PCR reaction system for DNA of Eupolyphaga sinensis
Notice bibliographique
Résumé
Objective To provide the basis for the genetic diversity research of Eupolyphaga sinensis by establishing and optimizing the random amplified microsatellite polymorphism RAMP-PCR reaction system and amplification procedure for genomic DNA.Methods Phenol chloroform extraction of genomic DNA was performed on female E.sinensis.Based on RAMP Primer(ISSR807 + RAPD A5),the orthogonal test was adopted to optimize the RAMP-PCR amplification system on E.sinensis in five factors(Mg2+,dNTPs,primer,Taq DNA polymerase,and template DNA) at four levels,and the suitable anneal temperature of the primer was selected.Results The optimal Primer(ISSR807+RAPD A5) for RAMP-PCR system(25 μL reaction volume) of E.sinensis was:10 × PCR buffer(2.5 μL),Mg2+(1.0 mmol/L),dNTPs(2.0 mmol/L),primer(0.5 μmol/L),Taq DNA polymerase(1 U),and template DNA(1.5 ng/μL);The optimized anneal temperature was 46.8 ℃.Conclusion The established and optimized RAMP-PCR reaction system is stable and repeatable,which could provide the basis for the analysis of germplasm resources and genetic diversity of E.sinensis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».