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Enregistrement W2354374923

Cloning and Expression Analysis of a Wheat Chitinase Gene Wch2

2003· article· en· W2354374923 sur OpenAlexaff
Liyan He

Notice bibliographique

RevueActa Photophysiologica Sinica · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueStudies on Chitinases and Chitosanases
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChitinaseStem rustBiologyGeneSignal peptideSouthern blotGene expressionMolecular biologySequence analysisCloning (programming)GeneticsPeptide sequence
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using a wheat chitinase gene fragment derived from PCR as probe, a Chid1 chitinase gene, Wch2 , was isolated from a wheat genomic library. Sequence analysis indicated that Wch2 encodes a peptide of 311 amino acids with no intron, which contains a signal peptide, a cysteine-rich chitin-binding domain, two variable regions and two catalytic domains (Fig.1). Southern blot hybridization showed that there are multiple copies of Wch2 in wheat genome (Fig.2). Infection with stem rust fungus Puccinia graminis induced a differential expression of Wch2 in a pair of near-isogenic wheat lines (Fig.3). In resistant isogenic line Chinese Spring Sr11(CS-Sr11), an induction of Wch2 transcript was detected 3 days after inoculation and a massive increase of the expression was observed 6 days after incolation. In contrast, in susceptible line Chinese Spring sr11(CS-sr11), expression of the chitinase gene was not detected during the time courses assayed. Crude bacterial extracts of Wch2 expressed in E.coli showed a clear chitinase activity towards chitin(Fig.4). These results suggest that Wch2 may play an important role in the induced resistance responses to the stem rust fungus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,600

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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