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Enregistrement W2355437540

Molecular Cloning and Sequence Analysis of DRM Gene Segment of Fraxinus mandschurica

2013· article· en· W2355437540 sur OpenAlexaff
Zeng Fan-su

Notice bibliographique

RevueAnhui nongye kexue · 2013
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueMedicinal Plant Pharmacodynamics Research
Établissements canadiensScience North
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenBankGeneBiologyHomology (biology)Phylogenetic treeGeneticsSequence analysisComplementary DNAMolecular cloningFraxinusPeptide sequenceMolecular biologyBotany
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

[Objective]The aim was to clone and analyze the domain remethylation enzyme(DRM) gene fragment of Fraxinus mandshurica.[Method]According to the sequence of DRM amino acid published in GenBank,a pair of degenerate primers was designed and synthesized by the CODEHOP method.DRM gene of F.mandshurica was amplified by RT-PCR technique.The PCR product was connected with pMD18- T and transformed into competent cells of E.coli JM109.Then the positive clone was identified and the sequence was sequenced and analyze.[Result]The cDNA sequences of cloned DRM gene with named FmadrmA was 802 bp in length,and coded 267 amino acid residues.Sequence alignment showed that FmadrmA presented high homology with other 12 species' DRM at the level of amino acid.Compared with the corresponding region of grape,tomato,cucumber,wild strawberry,soybean,alfalfa,corn,tobacco,Arabidopsis,poplar,rice and wheat,the protein homology of F.mandshurica was 61%,54%,51%,50%,60%,48%,43%,44%,37%,42%,42% and 39%,respectively.Phylogenetic tree analysis indicated that the DRM proteins with homology could be roughly classified into three categories,and F.mandshurica had a far genetic relation with other palnts.[Conclusion]The FmadrmA gene fragment of F.mandshurica was obtained successfully,and the homology was analyzed.It laid the foundation for the further research on domain remethylase gene and analysis of its expression characteristics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,282
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,451
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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