In Silico Cloning,Bioinformatics and Adaptive Evolution Analysis of rbcL Gene in Chrysanthemum morifolium
Notice bibliographique
Résumé
Objective:Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase(Rubisco)from Chrysanthemum morifolium was cloned in silico cloning.rbcLgene sequences in silico cloning,properties of encoding amino acid and adaptive evolution were analyzed.Method:According to the related literature,a full-length rbcLgene sequences form Chrysanthemum morifolium was cloned in silico cloning,and the structure and function of rbcLprotein were predicted by bioinformatics analysis.In the site-specific model,we found amino acid positive selection sites inrbcLgene.Result:A complete open reading frame sequences of electronic cloning chrysanthemumrbcLgene was 1 452 bp and encoded 483 amino acids.rbcLprotein secondary structure has 19α-helices and 18β-sheets.Seven amino acid sites(228S,255 V,279T,309 M,328S,439 T,449T)were found under positive selection.Conlusion:The complete sequence fromChrysanthemum morifolium rbcLgene in silico cloning provided certain reference data for further study,and encoded protein adaptability research was helpful to explore the mechanism of compositae adapting to the environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».