MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2364019637

Diagnostic Value of Specific Protein Fragment RV3425 and Fusion Protein CFP10-ESAT6 in Tuberculosis Antibody Detection

2011· article· en· W2364019637 sur OpenAlexaff
Jing Wu

Notice bibliographique

RevueLetters in Biotechnology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusion proteinEpitopeMycobacterium tuberculosisRecombinant DNAAntigenAntibodyTuberculosisPlasmidMolecular biologyVirologyBiologyGeneMedicineImmunologyGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective:Bioinformatics analysis and epitope prediction of Rv3425 in Mycobacterium tuberculosis.Evaluating the diagnostic value of Rv342519-176 recombinant protein and CFP10-ESAT6 fusion protein in tuberculosis(TB).Methods:The gene coding 19~176 amino acid fragment of Rv3425 was amplified from Mycobacterium tuberculosis genome by PCR.Prokaryotic expression vector of Rv342519-176 was constructed and recombinant protein(rRv342519-176) and CFP10-ESAT6 fusion protein(rCFP10-ESAT6) were expressed and purified.Establishing ELISA testing method with recombinant protein and fusion protein for antigen,and assessing the combined value of two proteins in TB-antibody detection.Results:The rRv342519-176 protein fragment with dominant epitope and rCFP10-ESAT6 were expressed effectively in E.coli.The ELISA result showed certain sensibility(39%) and high specificity(97.5%),when rRv342519-167 was antigen for clinical diagnosis in tuberculosis.The sensibility and specificity were respectively 37% and 95%,when rCFP10-ESAT6 was antigen.Furthermore,two proteins conjoint analysis by ELISA showed higher sensibility(57%) and specificity(95%).Conclusion:The epitope of Rv3425 was predicted by bioinformatics.The expressed and purified rRv342519-167 and rCFP10-ESAT6 had a certain complementary antigen in TB-antibody detection,and provided a reference with improving the diagnostic sensitivity in joint diagnostic antigen with keeping high specificity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLetters in BiotechnologyMême sujetTuberculosis Research and EpidemiologyTravaux en français237 207