Lytic Replication and Inductive Production of Recombinant Epstein Barr Virus Visualized
Notice bibliographique
Résumé
In order to study single viral gene functions in the context of genome and analysis interactions between one gene with another, the HEK293/p2089 stable cell line was established by transfecting the plasmid of DNA (p2089) into EBV-negative 293 cells and selecting for resistance against hygromycin. The plasmid p2089, which was kindly provided by Prof.Hammerschmidt, contained the whole EBV genome of wild-type B95-8. Two eukaryotic expression vectors (pcDNA3.1(+)/BZLF1 and pcDNA3.1(+)/BALF4) were constructed and then transiently cotransfected into the HEK293/p2089 stable cells, so as to induct EBV lytic replication and product recombinant EBV particles visualized through GFP-expressing. To estimate the EBV production, Raji cells were incubated with supernatants from the induced 293 cells carrying p2089 DNA, as revealed by indirect visualization of the Raji cells. GFP-positive cells were evaluated by inverted fluorescence microscope or FACS analysis. The different virus supernatants were quantified with the help of green Raji units per ml as an absolute number of infectious particles. This technique makes it possible for the reconstitution of viral progeny or mutants by transfection of BAC plasmid into eukaryotic cells, and any genetic modification in E. coli, thereby facilitating the analysis of viral gene functions in the context of genome. This new technique has provided a useful tool for the study of pathogenesis mechanism of EBV, especially for that of cancer-associated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».