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Enregistrement W2365169081

Cloning, sequence analysis, and prokaryotic expression vector construction of glycosyltransferase gene BcUGT8 from Bupleurum chinense

2013· article· en· W2365169081 sur OpenAlexaff
XU Jie-se

Notice bibliographique

RevueZhongcaoyao · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNatural product bioactivities and synthesis
Établissements canadiensScience North
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComplementary DNACloning (programming)BiologyExpression vectorMolecular biologySequence analysisGeneCloning vectorRestriction enzymeRapid amplification of cDNA endsclone (Java method)Recombinant DNAMolecular cloningGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To clone the full-length cDNA of the uridine diphosphate glycosyltransferase(UGT) gene in Bupleurum chinense(BcUGT8),which may be involved with the saikosaponin biosynthesis,and to construct the prokaryotic expression vector.The work will provide the foundation for its further function verification by in vitro expression and activity analysis of the purified protein.Methods RACE and LD-PCR were used to clone the full-length cDNA of BcUGT8,on the basis of its partial cDNA sequence obtained from our previous high-flux sequencing by Roche(454) GS FLX system.The open reading form(ORF) was PCR cloned using primers with corresponding restriction enzymes cutting sites.The PCR products were digested with corresponding restriction enzymes and then were inserted in expression vector pET-28a(+) to construct the recombinant expression vectors.Results The full-length cDNA of UGT gene was cloned from B.chinense,and the prokaryotic expression vector was obtained.Conclusion The full-length cDNA cloning,sequence analysis,and prokaryotic expression vector construction provide a substantial foundation for follow-up bio-function analysis of BcUGT8 through protein expression,purification,and activity analysis in vitro.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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