MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2370487327

Development and Application of Molecular Markers Specific to Chromosome 6VS of Haynaldia villosa

2007· article· en· W2370487327 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueEurope PMC (PubMed Central) · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePowdery Mildew Fungal Diseases
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCommon wheatChromosomal translocationPowdery mildewVillosaChromosomeGeneticsBiologyPrimer (cosmetics)GeneBotanyChemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The resistance gene of powdery mildew was introduced from Haynaldia villosa into common wheat(Triticum aestivum) and located on 6VS and designated as Pm21.In order to precisely map and clone Pm21,more molecular markers and chromosome structural variants need to be developed.RGA and STS markers,usually from expressed sequences,have proved to be very effective DNA markers.In order to development and application of molecular markers specific to chromosome 6VS of H.villosa,the DNA polymorphic analysis was performed on common wheat Yangmai 5,H.villosa and wheat-H.villosa 6VS/6AL translocation lines with 11 RGA and 17 pairs of STS primers.Two polymorphic fragments,about 1 000 bp and 800 bp,were amplified by a RGA primer Pto kin4 and a pair of STS primer,and then were cloned and sequenced,respectively.Based on the cloning sequences,two pairs of specific markers,CINAU17-1086 and CINAU18-723,were developed,and used to amplify common wheat Chinese Spring,Yangmai 5,Yangmai 158,H.villosa and T.durum-H.villosa amphiploid,wheat-H.villosa alien addition lines(1V-7V),wheat-H.villosa 6VS/6AL translocation line 92R137.The results indicated that two markers,CINAU17-1086 and CINAU18-723,were located on chromosome 6VS because only the materials with 6VS chromosome could amplify the specific patterns.Furthermore,CINAU17-1086 was located between FL0.58 and FL0.70 and CINAU18-723 between FL0.45 and centromere on chromosome 6VS by using 6VS deletion addition lines and translocation lines.The results obtained from these two markers were consistent with those from the cytogenetic identification to variant materials of chromosome 6VS obtained by radiating pollen.Therefore,CINAU17-1086 and CINAU18-723 markers could be used to rapidly detect the correspondent chromosome segments of 6V in common wheat and primarily identify the breakage points of deletion lines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEurope PMC (PubMed Central)Même sujetPowdery Mildew Fungal DiseasesTravaux en français237 207