Analysis of differentially expressed transcripts in early and middle development of Betula platyphylla female inflorescence
Notice bibliographique
Résumé
Betula platyphylla is a monoecious tree species with unisexual flowers,which plays an important role in the study of floral development of woody plants. This study aims to initially identify gene expression and regulation during the critical periods of female flower development in B. platyphylla,megasporogenesis( prophase) and gametophyte development( metaphase),and to discover genes related to female floral development. Firstly,we ascertained the prophase and metaphase in female floral development by the cytological method. Secondly,the establishment of forward and reverse suppression subtractive hybridization( SSH) c DNA libraries BHHQ and BHHZ were carried out with the c DNA of prophase and metaphase female inflorescence as tester and driver respectively,using SSH technique. A total of 1406 high quality EST sequences were obtained,787 of them having high homologies with the nucleic acid or protein sequences in databases and 47 genes possibly associating with flower development.The results of GO analysis showed that 34. 96% of these genes are mainly involved in biosynthesis process,16. 45% in cellular component and 48. 59% in molecular function. Six flower developmentrelated genes were analyzed by qRT-PCR analysis and the results showed that each of these genes has some expression in different tissues. Among them,the expression level of bhhq. 408,bhhq. 435,bhhz.359,and bhhz. 215 in reproductive organs was significantly higher than that in other organs,respectively;both bhhq. 254 and bhhq. 190 have some expression in most tissues,confirming that these genes are notonly involved in the development of reproductive organs,but also play some roles in vegetative organs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».