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Enregistrement W2375912943

Isolation and Sequence Analysis on Puroindoline Genes of Grain Hardness in Psathyrostachys Huashanica

2011· article· en· W2375912943 sur OpenAlexvenueno aff
Yang Qunhui

Notice bibliographique

RevueSeed · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant tissue culture and regeneration
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneGeneticsPeptide sequenceBiologySecaleSequence analysisPhylogenetic treeNucleic acid sequenceMolecular biologyBotany
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Puroindoline a(HM 448475)and Puroindoline b(HM 448476) genes of Psathyrostachys huashanica were isolated by AS-PCR method.Nucleotide sequence analysis showed that the similarity in these two sequences was only 69.25%,and the identity of these two sequences with the Puroindoline gene of relative species,such aTriticum,Aegilops,Secale,Avena,and Hordeum so on,were more than 93%.Deduced amino acid sequence analysis demonstrated that the sequence HM 448475(Pin a) and HM 448476(Pin b) all had the typical structural features of Puroindoline gene in cereal crop,containing the signal peptide of 19 amino acid residues,the tryptophan motif of WRWWKWWK(Pin a) or WPTKWWK(Pin b),and the location fixed 10 cysteine residues.Meanwhile,compared with the amino acid sequence of Puroindoline gene in relative species,the two sequences HM 448475(Pin a) and HM 448476(Pin b) had fifteen and eight major sites difference,respectively.Phylogenetic tree analysis indicated that the sequence(HM 448475) might be a new type of Pin a gene family,and sequence(HM 448476) might has a relatively near homologous with Hordoindoline b gene(GU 214830) of Hordeum chilense.This result suggested that P.huashanica contain the different Puroindoline gene alleles to control the grain hardness.The studies had important significance for enriching and improving wheat resources of grain hardness,and for protecting and exploiting the advantageous genes of the endangered species P.huashanica.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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