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Enregistrement W2381270640 · doi:10.1038/srep25853

Childhood gene-environment interactions and age-dependent effects of genetic variants associated with refractive error and myopia: The CREAM Consortium

2016· article· en· W2381270640 sur OpenAlex
Qiao Fan, Xiaobo Guo, J. Willem L. Tideman, Katie Williams, Seyhan Yazar, S. Mohsen Hosseini, Laura D Howe, Beaté St Pourcain, Nicholas J. Timpson, George McMahon, Pirro G. Hysi, Eva Krapohl, Ya Xing Wang, Paul N. Baird, Yik-Ying Teo, Tien Yin Wong, Xiaohu Ding, Robert Wojciechowski, Terri L. Young, Olavi Pärssinen, Norbert Pfeiffer, Joan E. Bailey‐Wilson, Andrew D. Paterson, Robert Plomin, Christopher J. Hammond, David A. Mackey, Mingguang He, Seang‐Mei Saw, Cathy Williams, Jeremy A. Guggenheim, Akira Meguro, Alan F. Wright, Alex W. Hewitt, Alvin L. Young, Andres Metspalu, Angela Döring, Anthony P. Khawaja, Barbara E.K. Klein, Brian W. Fleck, Caroline Hayward, Cécile Delcourt, Chi Pui Pang, Chiea Chuen Khor, Christian Gieger, Claire L. Simpson, Cornelia M. van Duijn, Dwight Stambolian, Emily Y. Chew, E Shyong Tai, Evelin Mihailov, George Davey Smith, Ginevra Biino, Harry Campbell, Igor Rudan, Ilkka Seppälä, Jaakko Kaprio, James F. Wilson, Jamie E. Craig, Janina S. Ried, Jean‐François Korobelnik, Jeremy Fondran, Jiemin Liao, Wei Zhao, Jing Xie, John P. Kemp, Jonathan H. Lass, Jugnoo S. Rahi, Juho Wedenoja, Kari-Matti Mäkelä, Kathryn P. Burdon, Kay‐Tee Khaw, Kenji Yamashiro, Li Jia Chen, Liang Xu, Lindsay A. Farrer, M. Kamran Ikram, Margaret M. DeAngelis, Margaux A. Morrison, Maria Schäche, Mario Pirastu, Masahiro Miyake, Maurice Yap, Maurizio Fossarello, Mika Kähönen, Milly S. Tedja, Nagahisa Yoshimura, Nicholas G. Martin, Nobuhisa Mizuki, Olli T. Raitakari, Ozren Polašek, Pancy O. S. Tam, Paul J. Foster, Paul Mitchell, Peng Chen, Phillippa Cumberland, Puya Gharahkhani, René Höhn, Rhys D. Fogarty, Robert Luben, Robert P. Igo, Ronald Klein, Sarayut Janmahasatian, Shea Ping Yip, Sheng Feng, Simona Vaccargiu, Songhomitra Panda‐Jonas, Stuart MacGregor, Sudha K. Iyengar, Taina Rantanen, Terho Lehtimäki, Thomas Meitinger, Tin Aung, Toomas Haller, Véronique Vitart, Vinay Nangia, Virginie J. M. Verhoeven, Vishal Jhanji, Wanting Zhao, Wei Chen, Xiangtian Zhou, Yi Lu, Zoran Vatavuk

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOphthalmology and Visual Impairment Studies
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Eye InstituteNational Medical Research CouncilNational Health and Medical Research CouncilFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Institutes of HealthMoorfields Eye Hospital NHS Foundation TrustMedical Research CouncilSun Yat-sen UniversityCurtin University of TechnologyJyväskylän YliopistoWellcome TrustOphthalmic Research Institute of AustraliaHong Kong Polytechnic UniversityBiomedical Research CouncilInstitute of Psychiatry, Psychology and Neuroscience, King’s College LondonRaine Medical Research FoundationQIMR Berghofer Medical Research InstitutePfizer AustraliaUniversity of BristolNational Institute for Health and Care ResearchNational Natural Science Foundation of ChinaResearch to Prevent BlindnessSouthwest HospitalAmerican Health Assistance FoundationPfizerNational Science Fund for Distinguished Young ScholarsNational Science Foundation
Mots-clésGenome-wide association studyRefractive errorGenetic variantsGenetic associationGeneticsBiologyMedicineDemographyGenePhysiologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphismEye disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myopia, currently at epidemic levels in East Asia, is a leading cause of untreatable visual impairment. Genome-wide association studies (GWAS) in adults have identified 39 loci associated with refractive error and myopia. Here, the age-of-onset of association between genetic variants at these 39 loci and refractive error was investigated in 5200 children assessed longitudinally across ages 7-15 years, along with gene-environment interactions involving the major environmental risk-factors, nearwork and time outdoors. Specific variants could be categorized as showing evidence of: (a) early-onset effects remaining stable through childhood, (b) early-onset effects that progressed further with increasing age, or (c) onset later in childhood (N = 10, 5 and 11 variants, respectively). A genetic risk score (GRS) for all 39 variants explained 0.6% (P = 6.6E-08) and 2.3% (P = 6.9E-21) of the variance in refractive error at ages 7 and 15, respectively, supporting increased effects from these genetic variants at older ages. Replication in multi-ancestry samples (combined N = 5599) yielded evidence of childhood onset for 6 of 12 variants present in both Asians and Europeans. There was no indication that variant or GRS effects altered depending on time outdoors, however 5 variants showed nominal evidence of interactions with nearwork (top variant, rs7829127 in ZMAT4; P = 6.3E-04).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,311

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle