Population Genomics Related to Adaptation in Elite Oat Germplasm
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Six hundred thirty five oat ( L.) lines and 4561 single-nucleotide polymorphism (SNP) loci were used to evaluate population structure, linkage disequilibrium (LD), and genotype-phenotype association with heading date. The first five principal components (PCs) accounted for 25.3% of genetic variation. Neither the eigenvalues of the first 25 PCs nor the cross-validation errors from = 1 to 20 model-based analyses suggested a structured population. However, the PC and = 2 model-based analyses supported clustering of lines on spring oat vs. southern United States origin, accounting for 16% of genetic variation ( < 0.0001). Single-locus -statistic () in the highest 1% of the distribution suggested linkage groups that may be differentiated between the two population subgroups. Population structure and kinship-corrected LD of = 0.10 was observed at an average pairwise distance of 0.44 cM (0.71 and 2.64 cM within spring and southern oat, respectively). On most linkage groups LD decay was slower within southern lines than within the spring lines. A notable exception was found on linkage group Mrg28, where LD decay was substantially slower in the spring subpopulation. It is speculated that this may be caused by a heterogeneous translocation event on this chromosome. Association with heading date was most consistent across location-years on linkage groups Mrg02, Mrg12, Mrg13, and Mrg24.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle