Optimization of RAPD and ISSR-PCR Reaction Systems for Radish (Raphanus sativus L.) Genomic DNA
Notice bibliographique
Résumé
The effect of different concentrations of template DNA,primer,dNTPs and Mg2+on the PCR reaction was analyzed and the optimized RAPD and ISSR-PCR systems in radish were established.The RAPD-PCR reaction was performed in a 18 L solution containing 0.4-0.6 μmol/L of RAPD primer,0.15-0.2 mmol/L of dNTPs,2.0 mmol/L of Mg2+,genomic DNA 10-40 ng and 0.8 U TaqDNA polymerase.The ISSR-PCR reaction was performed in a 16 μl solution containing 0.5 μmol/L of primer,0.16 mmol/L of dNTPs,2.5 mmol/L of Mg2+,10-40 ng template DNA and 0.64 U TaqDNA polymerase.Gradient PCR experiment showed,The annealing temperature of 35-42 ℃ (37 ℃) and 52.4-58.3 ℃(55 ℃) are suitable for RAPD and ISSR-PCR in radish,respectively.17 radish cultivars were fingerprinted with the optimized systems.The systems would play an important role in molecular breeding,cultivar fingerprinting and seed purity testing in radish.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».